15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0771 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  63.24 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  64.17 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  55.31 
 
 		 323 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  59.39 
 
 		 207 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  29.1 
 
 		 482 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  32.68 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  30.82 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  31.03 
 
 		 466 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  27.79 
 
 		 465 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  29.72 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  38.41 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  25.39 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  32.18 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>