14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0196 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  59.39 
 
 		 324 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  57.56 
 
 		 325 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  55.33 
 
 		 323 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  64.84 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  32.37 
 
 		 482 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  33.97 
 
 		 470 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  33.56 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  35.71 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  28.3 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  33.17 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  29.63 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  26.92 
 
 		 465 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  30.6 
 
 		 453 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>