18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0646 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  943    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  71.65 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  50.86 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  68.68 
 
 		 243 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  40.12 
 
 		 482 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  34.15 
 
 		 470 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  32.36 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  27.35 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  29.64 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  38.51 
 
 		 199 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  31.03 
 
 		 324 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  31.6 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  30.23 
 
 		 325 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  29.77 
 
 		 323 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  34.13 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  39.74 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  41.89 
 
 		 131 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  34.83 
 
 		 89 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>