75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3540 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  46.34 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  44.59 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  46.67 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  37.93 
 
 		 465 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  44.59 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  34.83 
 
 		 466 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1796  PAAR repeat-containing protein  47.95 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  44.44 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  39.19 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  42.25 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  34.83 
 
 		 466 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  41.25 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  39.24 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  40.79 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  47.37 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  44.59 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  39.73 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  43.75 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  43.24 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  41.56 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  41.56 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  36.49 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  39.73 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  41.56 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  39.47 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  37.66 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  39.47 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  40.54 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  33.78 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1553 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  38.36 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  34.67 
 
 		 89 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  38.96 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  35.62 
 
 		 88 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  38.03 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  34.67 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  35.62 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  39.44 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1381 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  36.84 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  36.84 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  36.84 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  36.84 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  38.89 
 
 		 615 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  36.84 
 
 		 141 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>