28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4177 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  67.74 
 
 		 96 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  54.74 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  56.84 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  54.76 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  44.79 
 
 		 615 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  41.76 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  42.71 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  40.86 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  39.36 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  39.36 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  39.78 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  39.78 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  38.3 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  38.64 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  39.78 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  38.3 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  40.91 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  34.78 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  35.96 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  36.56 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2633  hypothetical protein  34.78 
 
 		 184 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  35.56 
 
 		 193 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  37.08 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  37.66 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  30.21 
 
 		 131 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>