27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1060 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  70.98 
 
 		 193 aa  284  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3015  hypothetical protein  56.38 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal  0.0180301 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2283  hypothetical protein  68.46 
 
 		 134 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2978  hypothetical protein  69.72 
 
 		 106 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  45 
 
 		 178 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  35.2 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  33.51 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2918  hypothetical protein  32.26 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3014  hypothetical protein  44.62 
 
 		 87 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0911189  normal  0.0167058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  32.22 
 
 		 94 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  35.56 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  31.11 
 
 		 94 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  31.11 
 
 		 94 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  34.44 
 
 		 96 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  30 
 
 		 94 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  29.55 
 
 		 94 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  35.23 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  29.55 
 
 		 94 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  30.68 
 
 		 94 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  34.69 
 
 		 95 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  29.03 
 
 		 94 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  29.03 
 
 		 94 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  37.18 
 
 		 178 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  30.23 
 
 		 615 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  29.03 
 
 		 94 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>