10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2283 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2283  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  68.46 
 
 		 193 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  64.62 
 
 		 193 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3015  hypothetical protein  61.11 
 
 		 184 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal  0.0180301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2978  hypothetical protein  64.15 
 
 		 106 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  38.84 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  39.85 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3014  hypothetical protein  53.62 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0911189  normal  0.0167058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  41.67 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>