16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3015 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3015  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal  0.0180301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  56.38 
 
 
193 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  56.38 
 
 
193 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2283  hypothetical protein  61.11 
 
 
134 aa  151  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  54.07 
 
 
178 aa  151  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2978  hypothetical protein  57.28 
 
 
106 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  38.22 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  31.45 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2918  hypothetical protein  30.69 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.942656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3014  hypothetical protein  45.31 
 
 
87 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0911189  normal  0.0167058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  32.95 
 
 
94 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  32.95 
 
 
94 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  31.82 
 
 
94 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  31.82 
 
 
94 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  31.82 
 
 
94 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>