56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2689 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  98.94 
 
 
94 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  98.94 
 
 
94 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  92.55 
 
 
94 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  91.49 
 
 
94 aa  176  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  91.4 
 
 
94 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  64.52 
 
 
94 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  60.87 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  59.78 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  59.78 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  42.53 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  39.33 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  47.31 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  43.62 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  37.93 
 
 
615 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  40.43 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  38.3 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  38.2 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  38.82 
 
 
200 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  36.96 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  37.63 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  44.26 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  34.12 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  37.63 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  39.78 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  38.71 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  37.23 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  37.23 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  37.23 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  37.23 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  34.83 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  38.04 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  36.84 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  36.84 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  37.63 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  37.63 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  35.96 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  35.71 
 
 
194 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  36.17 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  36.17 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  36.17 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  38.3 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  38.67 
 
 
188 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  35.23 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3015  hypothetical protein  31.82 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal  0.0180301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  33.73 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  38.96 
 
 
89 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  39.78 
 
 
176 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  39.78 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  35.82 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  34.94 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  35.48 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  32.1 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  33.73 
 
 
83 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>