26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2607 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3015  hypothetical protein  54.07 
 
 
184 aa  151  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal  0.0180301 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  46.78 
 
 
193 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  45 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2283  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2604  hypothetical protein  41.12 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.15466 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2633  hypothetical protein  29.95 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  30.94 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  30.14 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  31.39 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  35.16 
 
 
94 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2600  hypothetical protein  48.08 
 
 
135 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  40.35 
 
 
94 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  32.34 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  36.84 
 
 
94 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  32.18 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  36.84 
 
 
94 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  32.18 
 
 
94 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  36.84 
 
 
94 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  34.78 
 
 
615 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0051  hypothetical protein  27.07 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0341142  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 
1114 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  32.97 
 
 
96 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>