50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3309 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  400  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  52.25 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  38.3 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2918  hypothetical protein  36.65 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  36.6 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3015  hypothetical protein  38.22 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal  0.0180301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  35.2 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2283  hypothetical protein  39.85 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  44.83 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  43.68 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  43.68 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  43.18 
 
 		 94 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  42.53 
 
 		 94 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  43.18 
 
 		 94 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  33.65 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  39.77 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2633  hypothetical protein  31.46 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  38.64 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2978  hypothetical protein  37.61 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3014  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0911189  normal  0.0167058 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  30.14 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  36.67 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  35.96 
 
 		 95 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  37.78 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 135 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  37.78 
 
 		 141 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  26.86 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  36.67 
 
 		 141 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  36.67 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  36.67 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  37.08 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  25.41 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  37.08 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  37.08 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  37.36 
 
 		 135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  35.96 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  35.96 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  35.96 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  26.47 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  26.06 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  29.33 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  26.09 
 
 		 175 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>