13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2633 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2633  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2918  hypothetical protein  64.23 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.942656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  31.46 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  29.95 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  33.87 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  29.41 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  25.41 
 
 
200 aa  50.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  34.78 
 
 
95 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2604  hypothetical protein  31.03 
 
 
126 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.15466 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  33.01 
 
 
95 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  27.78 
 
 
615 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  29.79 
 
 
95 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>