24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6317 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  50.54 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  48.91 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  49.46 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  49.46 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  48.39 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  48.39 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  47.83 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  47.31 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  46.24 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  46.24 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  41.25 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  40.45 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  43.82 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  41.94 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  39.29 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  38.2 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  42.86 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  34.78 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  36.25 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  28.4 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>