20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1854 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  207  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  54.76 
 
 
95 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  55.17 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  55.38 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  48.15 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
615 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  39.29 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  40.7 
 
 
94 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  37.62 
 
 
200 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  45.9 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  39.53 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  39.53 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  45.9 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  45.9 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  44.26 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  44.26 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  44.26 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  37.21 
 
 
193 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  42.86 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>