15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0243 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  707    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  28.96 
 
 		 482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  30.99 
 
 		 470 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  29.13 
 
 		 466 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  30.82 
 
 		 324 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  26.95 
 
 		 466 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  29.43 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  27.89 
 
 		 465 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  26.16 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  29.28 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  25.42 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  36.72 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  27.62 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  20.88 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>