15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5213 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  989    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  41.49 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  39.64 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  36.59 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  29.24 
 
 		 470 aa  156  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  43.23 
 
 		 243 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  33.55 
 
 		 325 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  28.66 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  28.79 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  29.79 
 
 		 323 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  28.93 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  25.39 
 
 		 453 aa  103  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 323 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  35.62 
 
 		 199 aa  94  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  31.88 
 
 		 207 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>