15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2085 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  76.23 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  67.16 
 
 		 466 aa  334  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  49.24 
 
 		 465 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  40.54 
 
 		 482 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  31.54 
 
 		 470 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  30.16 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  28.69 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  31.61 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  31.07 
 
 		 325 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  37.1 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  30.12 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  29.63 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  24.7 
 
 		 453 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>