70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4258 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 169 aa  343  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  57.58 
 
 		 174 aa  191  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  61.05 
 
 		 96 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  48.98 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  59.55 
 
 		 323 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  53.26 
 
 		 94 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  59.78 
 
 		 94 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  40.76 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  37.67 
 
 		 540 aa  84.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  50.52 
 
 		 592 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  48.28 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  46.88 
 
 		 466 aa  74.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  45.45 
 
 		 456 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  45.92 
 
 		 456 aa  72  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  46.94 
 
 		 461 aa  72  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  46.88 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  37.06 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  36.05 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  46.74 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  35.39 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1553 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  46.24 
 
 		 895 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1381 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1541 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1541 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1541 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1541 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1541 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1541 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 100 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  44.3 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  41.56 
 
 		 1487 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  45.35 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  39.33 
 
 		 1494 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  39.33 
 
 		 1494 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  32.37 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  43.84 
 
 		 1140 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  40.79 
 
 		 1386 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  38.96 
 
 		 1495 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  32 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  38.27 
 
 		 1385 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  45.45 
 
 		 885 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  38.27 
 
 		 1400 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  33.94 
 
 		 1419 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  37.66 
 
 		 1517 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1409 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  39.74 
 
 		 1421 aa  47.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  35.9 
 
 		 1446 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  40 
 
 		 96 aa  47.4  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  37.66 
 
 		 1527 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  39.51 
 
 		 1475 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  34.78 
 
 		 386 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  41.25 
 
 		 855 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  40.59 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  39.51 
 
 		 1457 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  40 
 
 		 908 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  38.1 
 
 		 1229 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 		 406 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  38.67 
 
 		 1423 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  36.36 
 
 		 1379 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0281  hypothetical protein  35.11 
 
 		 84 aa  43.9  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 		 911 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  35.53 
 
 		 1411 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  37.18 
 
 		 1422 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  34.94 
 
 		 439 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  34.94 
 
 		 434 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  38.64 
 
 		 771 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  34.74 
 
 		 1428 aa  40.8  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 88 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>