73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0532 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 88 aa  170  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  85.33 
 
 		 88 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  84.51 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  54.26 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  60.64 
 
 		 94 aa  94.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  56.32 
 
 		 540 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  55.56 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  52.13 
 
 		 176 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  50.51 
 
 		 592 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  54.65 
 
 		 466 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  53.54 
 
 		 461 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  45.65 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  53.66 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  51.52 
 
 		 456 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  46.74 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  45.12 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  47.47 
 
 		 456 aa  74.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  38.55 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  47.83 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  55.07 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  48.33 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  37.8 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  35.79 
 
 		 855 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  47.54 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  45.59 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  39.13 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  38.81 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  31.37 
 
 		 1446 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  44.26 
 
 		 469 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  32.63 
 
 		 1229 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  38.1 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1410 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  38.55 
 
 		 1530 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  46.43 
 
 		 481 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  34.62 
 
 		 1422 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  33.73 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  35.37 
 
 		 1475 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  35.37 
 
 		 1457 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  44.29 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  38.55 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  39.58 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 87 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  46.15 
 
 		 96 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  43.86 
 
 		 179 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  40.24 
 
 		 102 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  49.06 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0281  hypothetical protein  34.62 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  37.66 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  51.22 
 
 		 1140 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  36.11 
 
 		 1423 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  45.31 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  41.18 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  38.33 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  46.38 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  51.61 
 
 		 1600 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  39.13 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0641  hypothetical protein  34.18 
 
 		 84 aa  40  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  39.44 
 
 		 89 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  39.44 
 
 		 89 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>