59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2184 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 88 aa  167  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  86.36 
 
 		 88 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  90.14 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  53.19 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  57.47 
 
 		 540 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  60.64 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  54.26 
 
 		 176 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  55.56 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  49.49 
 
 		 592 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  52.53 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 		 466 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  49.49 
 
 		 456 aa  77  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  55.26 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  47.56 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  46.74 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  47.47 
 
 		 456 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  46.74 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  51.81 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  41.86 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  47.83 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  38.37 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  46.67 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  38.64 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  37.89 
 
 		 855 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  34.74 
 
 		 1229 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  33.33 
 
 		 1446 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  37.5 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  37.18 
 
 		 1422 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  44.87 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  50.77 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  40.28 
 
 		 1423 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  38.46 
 
 		 1475 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  38.46 
 
 		 1457 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  46.84 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  41.1 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  41.1 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  42.71 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  41.33 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  36.05 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  34.52 
 
 		 1530 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1410 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  39.71 
 
 		 1428 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  47.69 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  46.75 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_002978  WD0281  hypothetical protein  38.96 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  34.62 
 
 		 1437 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  34.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  39.13 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  47.69 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  43.64 
 
 		 481 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  51.22 
 
 		 1140 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.79 
 
 		 1359 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 83 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  51.61 
 
 		 1600 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  39.76 
 
 		 87 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>