More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02686 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  100 
 
 		 139 aa  273  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  70.5 
 
 		 140 aa  201  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  66.91 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.19 
 
 		 145 aa  179  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.22 
 
 		 144 aa  167  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.22 
 
 		 144 aa  167  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  61.15 
 
 		 145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.15 
 
 		 144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  60.74 
 
 		 144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.48 
 
 		 144 aa  163  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  60.74 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  60.74 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.74 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.48 
 
 		 144 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  61.48 
 
 		 144 aa  159  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  56.93 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.85 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  60.29 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.82 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.88 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.47 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.85 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  54.48 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.82 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  56.59 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.28 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  51.11 
 
 		 146 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  53.33 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  53.33 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  53.68 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  48.23 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  48.23 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  52.24 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  52.24 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  47.33 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  44.14 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  46.1 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  44.14 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.06 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  44.83 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  43.75 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.75 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  46.81 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  43.45 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  43.45 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  48.82 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  47.18 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.07 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  46.1 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  39.29 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  46.27 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0260  colicin uptake protein TolR  44.93 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00469758  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  42.54 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.65 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  42.54 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.28 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  42.75 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  41.79 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.73 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  41.79 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 		 162 aa  99.4  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  41.79 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  41.79 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.46 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  41.04 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  41.04 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  41.04 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  41.04 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  41.98 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.51 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  38.17 
 
 		 139 aa  95.9  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  45.93 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.23 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1277  colicin uptake protein TolR  44.85 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179595  hitchhiker  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.01 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  41.41 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.46 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  40.44 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  40.44 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  40.48 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  40.44 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  44.09 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  39.42 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2904  colicin uptake protein TolR  45.52 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.036935  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  41.01 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  43.65 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2870  colicin uptake protein TolR  44.12 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760123  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2958  colicin uptake protein TolR  44.12 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  39.85 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1395  colicin uptake protein TolR  44.12 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000355274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1247  colicin uptake protein TolR  44.85 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  41.04 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>