More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6860 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  91.59 
 
 		 228 aa  410  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  91.59 
 
 		 230 aa  410  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  90.54 
 
 		 222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  90.45 
 
 		 231 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  79.15 
 
 		 222 aa  333  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  75.94 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  72.05 
 
 		 230 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  71.04 
 
 		 222 aa  305  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  46.39 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  46.6 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  46.6 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  45.73 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  49.23 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  46.6 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 221 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  43.37 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  44.39 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  43.14 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  44.2 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  43.55 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  45.3 
 
 		 224 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 237 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 256 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 233 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 235 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 230 aa  98.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  32.66 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>