More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4099 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  36.41 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.35 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.9 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  35.71 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.87 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.5 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.85 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32.79 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  34.05 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.24 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.49 
 
 		 224 aa  95.5  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  31.47 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.65 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  34.01 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.65 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  31.88 
 
 		 211 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.62 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  32.52 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.96 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.47 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  32.52 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.26 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.77 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.96 
 
 		 225 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  31.61 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.53 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.43 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3715  cAMP-regulatory protein  32.12 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.088887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  30.46 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.39 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  28.22 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  28.14 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.46 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  32.04 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04006  cAMP-regulatory protein  31.94 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  32.52 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  29.21 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  34.18 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0879  cAMP-regulatory protein  29.61 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000144762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  31.34 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.21 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  29.21 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  32.46 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  29.21 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  29.21 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  29.21 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.69 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  29.21 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  29.21 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  32.31 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  32.31 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0792  cAMP-regulatory protein  29.61 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  32.47 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  32.31 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  29.21 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.22 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  27.5 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  27.5 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>