More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0583 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  53 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  59.45 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  53.2 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  52.13 
 
 		 319 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  53.47 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  55.52 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  54.85 
 
 		 308 aa  288  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  51.74 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  52 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  49.66 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  52.08 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  50.35 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  51.39 
 
 		 314 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  49.49 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  53.11 
 
 		 319 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  49.15 
 
 		 317 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  48.65 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  42.26 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  42.32 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  33.47 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  27.75 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  23.08 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 		 208 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  22.77 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.87 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.18 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  28.18 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  22.78 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 208 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  29.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  29.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  25.42 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  24.24 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.23 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  28.03 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  25.99 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  32.34 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  29.88 
 
 		 242 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  29.21 
 
 		 213 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  26.34 
 
 		 209 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  31.9 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  28.85 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  27.78 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 237 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.14 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  29.27 
 
 		 242 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 237 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  29.52 
 
 		 230 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 212 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  30.2 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  24.14 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>