254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4571 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 168 aa  331  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  71.72 
 
 		 107 aa  137  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  68.09 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  69.47 
 
 		 108 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 111 aa  130  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  71.43 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  73.26 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  67.37 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  69.66 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  68.89 
 
 		 117 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  68.89 
 
 		 117 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  68.89 
 
 		 117 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  74.07 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  60.42 
 
 		 109 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 125 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  53.49 
 
 		 119 aa  98.2  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 		 119 aa  96.3  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  52.69 
 
 		 124 aa  96.3  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 		 119 aa  94.4  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 115 aa  94  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 		 112 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  48.84 
 
 		 119 aa  90.5  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  48.84 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  53.57 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  47.62 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  41.03 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  46.67 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 116 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  38.2 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.97 
 
 		 114 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 124 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 124 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 124 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  41.94 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  41.94 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 117 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  44.78 
 
 		 94 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 129 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 103 aa  50.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 122 aa  50.8  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 116 aa  50.8  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  42.62 
 
 		 86 aa  50.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  41.79 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 99 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.02 
 
 		 228 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.02 
 
 		 228 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 224 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 109 aa  48.5  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 235 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 399 aa  48.5  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 99 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 118 aa  48.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  45.76 
 
 		 105 aa  48.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 108 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 234 aa  48.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 126 aa  48.1  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 119 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 108 aa  47.8  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 241 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 241 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40.98 
 
 		 109 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  37.1 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>