114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0027 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  50.63 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  44.16 
 
 		 323 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  48.36 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  44.12 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  43.97 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  41.45 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  44.54 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  41.42 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  45.8 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  38.96 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  42.24 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  37.29 
 
 		 412 aa  156  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  40.34 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  43.2 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  37.18 
 
 		 556 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  36.89 
 
 		 312 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  34.62 
 
 		 368 aa  143  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  36.48 
 
 		 521 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  33.97 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  32.09 
 
 		 298 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  33.46 
 
 		 353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  35.04 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  45.58 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  35.62 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  30.2 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  35.92 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  34.89 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  30.8 
 
 		 268 aa  99  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  26.84 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  36.05 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  34.1 
 
 		 197 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  25.85 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  32.37 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  32.37 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  32.73 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.1 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  37.8 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  31.08 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  24.28 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  24.28 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  25 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  35.67 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  23.55 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  27.59 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  29.93 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  27.08 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  26.39 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  33.61 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  28.57 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  29.51 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.06 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  33 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  28.87 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  26.06 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  25.53 
 
 		 327 aa  52  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  29.37 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  40.24 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  28.77 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  19.9 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.24 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  29.08 
 
 		 320 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  30.77 
 
 		 199 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  34.29 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  32 
 
 		 298 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  26.43 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  29.45 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  24.55 
 
 		 377 aa  48.9  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  25.74 
 
 		 267 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  25.74 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  30.3 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  31.4 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  30.5 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  25.9 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  26.67 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0452  sortase family protein  32.85 
 
 		 352 aa  46.6  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28 
 
 		 336 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  25.18 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  29.6 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  27.94 
 
 		 291 aa  45.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  23.74 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  25.38 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  24.43 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  22.3 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  26.92 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  25.19 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  19.79 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  21.09 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  24.48 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  28.69 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  23.11 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  25.41 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  31.09 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  35.82 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  23.33 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  32.94 
 
 		 301 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  23.33 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>