More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0007 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  60.25 
 
 
709 aa  775    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  54.05 
 
 
765 aa  703    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
709 aa  1407    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  64.23 
 
 
767 aa  442  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  36.72 
 
 
692 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34.42 
 
 
639 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  33.1 
 
 
649 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.54 
 
 
647 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  32.87 
 
 
647 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  32.52 
 
 
647 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  33.1 
 
 
644 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 
647 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 
628 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.3 
 
 
647 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 
626 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 
626 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  32.58 
 
 
647 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  31.67 
 
 
695 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  32.3 
 
 
647 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 
668 aa  348  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  30.88 
 
 
680 aa  346  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  32.27 
 
 
659 aa  345  2e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 
656 aa  343  9e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  30.27 
 
 
644 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  30.9 
 
 
647 aa  342  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  34.27 
 
 
730 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  29.55 
 
 
669 aa  334  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  34.92 
 
 
620 aa  334  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  28.71 
 
 
645 aa  320  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 
691 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  31.15 
 
 
624 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  28.75 
 
 
674 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  34.72 
 
 
622 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 
640 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  30.87 
 
 
644 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  33.98 
 
 
670 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 
629 aa  303  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.23 
 
 
621 aa  301  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  33.57 
 
 
705 aa  301  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 
636 aa  301  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  29.1 
 
 
674 aa  300  7e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  32.86 
 
 
625 aa  300  8e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  34.23 
 
 
681 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  33.15 
 
 
644 aa  296  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  30.99 
 
 
629 aa  296  8e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 
623 aa  294  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 
623 aa  294  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  34.42 
 
 
628 aa  294  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3218  DNA mismatch repair protein MutL  62.71 
 
 
738 aa  290  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  43.81 
 
 
559 aa  289  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  31.19 
 
 
624 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  30.61 
 
 
630 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  34.09 
 
 
652 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  30.97 
 
 
632 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 
644 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  30.54 
 
 
685 aa  283  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  32.96 
 
 
651 aa  282  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  47.08 
 
 
585 aa  280  8e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  31.93 
 
 
641 aa  280  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  33.01 
 
 
687 aa  277  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  30.93 
 
 
626 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  29.67 
 
 
630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  32.1 
 
 
603 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  40.91 
 
 
762 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  38.61 
 
 
602 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  32.39 
 
 
648 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  37.07 
 
 
619 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  40.19 
 
 
612 aa  264  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  40.85 
 
 
755 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  31.73 
 
 
637 aa  263  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  39.4 
 
 
665 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  40.28 
 
 
647 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  43.5 
 
 
566 aa  261  4e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  40.5 
 
 
622 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  43.5 
 
 
566 aa  259  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  43.5 
 
 
566 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  44.01 
 
 
605 aa  258  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  46.53 
 
 
565 aa  258  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  42.9 
 
 
606 aa  256  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  42.01 
 
 
631 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  43.58 
 
 
605 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  45.18 
 
 
560 aa  254  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  42.47 
 
 
612 aa  253  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  43.67 
 
 
586 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  44.58 
 
 
603 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  45.71 
 
 
608 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  39.62 
 
 
630 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  36.76 
 
 
630 aa  251  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  41.57 
 
 
692 aa  251  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  29.46 
 
 
673 aa  251  4e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  31.4 
 
 
661 aa  251  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  39.42 
 
 
601 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  39.29 
 
 
628 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  41.06 
 
 
589 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  45.71 
 
 
607 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  42.39 
 
 
603 aa  249  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  45.71 
 
 
607 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  39.82 
 
 
614 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  31.55 
 
 
652 aa  247  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  40.56 
 
 
647 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>