100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6275 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  100 
 
 		 741 aa  1469    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  32.62 
 
 		 820 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  28.79 
 
 		 816 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  29.35 
 
 		 731 aa  193  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  27.56 
 
 		 742 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  26.75 
 
 		 742 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  27.29 
 
 		 742 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  30.81 
 
 		 762 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.97 
 
 		 885 aa  163  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.52 
 
 		 826 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  26.16 
 
 		 782 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  34.6 
 
 		 898 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  34.08 
 
 		 898 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  33.65 
 
 		 898 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  23.5 
 
 		 936 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.24 
 
 		 639 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.1 
 
 		 639 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  24.66 
 
 		 639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  25.07 
 
 		 639 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  24.9 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  25.13 
 
 		 639 aa  132  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  25.16 
 
 		 639 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  25.29 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  26.48 
 
 		 758 aa  125  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  26.98 
 
 		 762 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  29.92 
 
 		 724 aa  121  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  31.33 
 
 		 725 aa  119  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  39.64 
 
 		 809 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  26.29 
 
 		 731 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  25.66 
 
 		 719 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  29.44 
 
 		 745 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.21 
 
 		 778 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  24.74 
 
 		 724 aa  115  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  25.08 
 
 		 765 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.08 
 
 		 895 aa  114  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  25.41 
 
 		 639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  24.64 
 
 		 738 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  25.21 
 
 		 764 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  24.11 
 
 		 893 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  26.78 
 
 		 731 aa  111  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  26.68 
 
 		 729 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  23.78 
 
 		 640 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  30.15 
 
 		 735 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  25.43 
 
 		 730 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  28.5 
 
 		 741 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  25.58 
 
 		 762 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  25.43 
 
 		 730 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  23.88 
 
 		 945 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  25.43 
 
 		 730 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  26.14 
 
 		 722 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  22.37 
 
 		 788 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  26.64 
 
 		 727 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  23.15 
 
 		 789 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  25.99 
 
 		 720 aa  102  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  22.76 
 
 		 788 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  23.33 
 
 		 646 aa  101  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  24.85 
 
 		 755 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  21.47 
 
 		 789 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  25.56 
 
 		 761 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  25.56 
 
 		 761 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  25.27 
 
 		 639 aa  95.5  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.96 
 
 		 762 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.69 
 
 		 764 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  25.57 
 
 		 822 aa  92.8  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.67 
 
 		 764 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  24.45 
 
 		 843 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.67 
 
 		 745 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  21.58 
 
 		 785 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  26.01 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  25.77 
 
 		 650 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25.77 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  26.69 
 
 		 729 aa  72  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  25.51 
 
 		 650 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  25.63 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  28 
 
 		 716 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  26.64 
 
 		 833 aa  67.4  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  25.35 
 
 		 650 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  22.92 
 
 		 653 aa  64.3  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  22.04 
 
 		 667 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  25.44 
 
 		 671 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  26.05 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1111 aa  58.2  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  58.54 
 
 		 2851 aa  57.4  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.2 
 
 		 714 aa  57.4  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  23.66 
 
 		 656 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  54.17 
 
 		 2914 aa  55.5  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  22.77 
 
 		 754 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.32 
 
 		 770 aa  52  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  24.67 
 
 		 656 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  25.22 
 
 		 655 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  22.19 
 
 		 657 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  21.35 
 
 		 663 aa  50.8  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.45 
 
 		 671 aa  49.3  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  21.15 
 
 		 660 aa  48.9  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  47.89 
 
 		 767 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  55 
 
 		 857 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  26.22 
 
 		 856 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4540  hypothetical protein  51.11 
 
 		 177 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  21.46 
 
 		 642 aa  44.3  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4827  hypothetical protein  54.05 
 
 		 204 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.788125  normal  0.10965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>