20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4827 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4827  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.788125  normal  0.10965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3316  hypothetical protein  32.32 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  56.76 
 
 		 2851 aa  48.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2155  hypothetical protein  29.21 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000244584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  57.14 
 
 		 437 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  61.54 
 
 		 582 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  65.79 
 
 		 492 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  54.76 
 
 		 434 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  54.76 
 
 		 451 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  56.82 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  54.76 
 
 		 437 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  54.76 
 
 		 437 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  52.17 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  54.76 
 
 		 439 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  46.67 
 
 		 580 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  64.71 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  57.5 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  60 
 
 		 523 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  67.65 
 
 		 493 aa  41.6  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  61.11 
 
 		 438 aa  41.2  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>