More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6213 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  42.19 
 
 		 1496 aa  749    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  42.53 
 
 		 1036 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  40.14 
 
 		 1032 aa  734    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  41.82 
 
 		 1047 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  40 
 
 		 1071 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  40.9 
 
 		 1044 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  41.13 
 
 		 1041 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  38.16 
 
 		 1050 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  42.09 
 
 		 1038 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  48.62 
 
 		 1028 aa  815    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  41.1 
 
 		 1045 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1055 aa  2088    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  39.17 
 
 		 1066 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  38.99 
 
 		 1095 aa  727    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  43.69 
 
 		 1470 aa  752    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 		 1011 aa  680    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  39.05 
 
 		 1075 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  48.21 
 
 		 1028 aa  851    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  48.81 
 
 		 1028 aa  868    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 		 1034 aa  643    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  43.17 
 
 		 1039 aa  773    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  41.13 
 
 		 1038 aa  741    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  48.86 
 
 		 1028 aa  867    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  41.81 
 
 		 1033 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  39.76 
 
 		 1065 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  40.09 
 
 		 1070 aa  728    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  41.31 
 
 		 1069 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  38.01 
 
 		 1062 aa  677    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  40.32 
 
 		 1054 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  40.42 
 
 		 1054 aa  635  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  40.51 
 
 		 1054 aa  632  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  40.68 
 
 		 1067 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  35.97 
 
 		 1009 aa  625  1e-177  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  37.18 
 
 		 1043 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  36.89 
 
 		 1031 aa  616  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1034 aa  611  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  34.87 
 
 		 1043 aa  611  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  34.84 
 
 		 1013 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  35.85 
 
 		 1044 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1053 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  33.93 
 
 		 1014 aa  601  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1044 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.57 
 
 		 1024 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  35.32 
 
 		 1073 aa  593  1e-168  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  35.13 
 
 		 1058 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  37.77 
 
 		 1101 aa  590  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1035 aa  591  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1177 aa  592  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.97 
 
 		 1024 aa  586  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1033 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  36.61 
 
 		 1029 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  36.53 
 
 		 1026 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1032 aa  586  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1041 aa  587  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 		 1171 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  36.44 
 
 		 1048 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 		 1022 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  38.13 
 
 		 1038 aa  586  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1048 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  34.34 
 
 		 1036 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  32.08 
 
 		 1040 aa  579  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  35.27 
 
 		 1041 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1034 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1064 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1040 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  36.64 
 
 		 1048 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  35.19 
 
 		 1022 aa  570  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1055 aa  570  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1029 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  36.59 
 
 		 1025 aa  567  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1042 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1058 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.65 
 
 		 1050 aa  568  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  34.9 
 
 		 1068 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 		 1044 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  37.35 
 
 		 1042 aa  568  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1063 aa  569  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  32.74 
 
 		 1058 aa  562  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1040 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  35.74 
 
 		 1039 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  35.68 
 
 		 1037 aa  562  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1039 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1059 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  36.26 
 
 		 1036 aa  558  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 		 1027 aa  558  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1041 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1041 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1051 aa  555  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  36.63 
 
 		 1035 aa  556  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1046 aa  556  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4555  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1042 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296261  normal  0.764409 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  36.59 
 
 		 1088 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  37.38 
 
 		 1028 aa  551  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.76 
 
 		 1032 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1037 aa  548  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 		 1027 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  35.1 
 
 		 1036 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5103  acriflavin resistance protein  35.87 
 
 		 1044 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  35.5 
 
 		 1036 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1055 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>