213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4614 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  100 
 
 
329 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  53.12 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  51.83 
 
 
327 aa  335  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  54.49 
 
 
332 aa  329  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  37.8 
 
 
323 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  35.31 
 
 
323 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  38.69 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  33.99 
 
 
335 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  37.85 
 
 
336 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  39.32 
 
 
279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  35.86 
 
 
310 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  33.33 
 
 
316 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  31.99 
 
 
282 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  36.48 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  35 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  39.04 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.21 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  34.22 
 
 
660 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  33.82 
 
 
310 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  36.84 
 
 
309 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  35.86 
 
 
275 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  38.12 
 
 
325 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  36.65 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  37.76 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  35.75 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  34.78 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  39.51 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  33.09 
 
 
320 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  34.05 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  35 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  32.82 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  30.99 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  31.64 
 
 
330 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  38.3 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  35.18 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  34 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  31.65 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  34.2 
 
 
325 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  34.18 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  36.79 
 
 
318 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  30.77 
 
 
320 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  30.26 
 
 
283 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  36.68 
 
 
325 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  34.04 
 
 
321 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  32.57 
 
 
321 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  37.35 
 
 
325 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  33.78 
 
 
325 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  34.22 
 
 
325 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  30.47 
 
 
316 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  33.85 
 
 
284 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  29.57 
 
 
325 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  31.58 
 
 
320 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  36.75 
 
 
325 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  29.26 
 
 
535 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  30.95 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  29.22 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  34.25 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  39.19 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  39.19 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  39.19 
 
 
325 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  26.59 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  25.96 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  30.94 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  36.69 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  29.35 
 
 
335 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  27.74 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  32.24 
 
 
325 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  36.31 
 
 
325 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  27.33 
 
 
337 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  28.34 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  27.75 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  34.24 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  28.13 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  32.49 
 
 
290 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.29 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  28.15 
 
 
317 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  28.1 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  35.19 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  26.36 
 
 
327 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  24.85 
 
 
323 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  25.68 
 
 
327 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  26.3 
 
 
336 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  29.7 
 
 
338 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  34.44 
 
 
322 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  25.48 
 
 
324 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  24.9 
 
 
328 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  30.57 
 
 
322 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  34.29 
 
 
317 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  33.77 
 
 
322 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  33.77 
 
 
322 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  28.75 
 
 
306 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  31.05 
 
 
328 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  25.9 
 
 
324 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  27.05 
 
 
324 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  35.62 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  23.49 
 
 
334 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.41 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.56 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  25.95 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  24.62 
 
 
322 aa  96.3  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>