More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3685 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  71.43 
 
 		 231 aa  338  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  66.23 
 
 		 230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  67.84 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  66.67 
 
 		 230 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  67.84 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  61.23 
 
 		 228 aa  278  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  60.09 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  46.26 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  46.72 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  47.19 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  47.11 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  48.23 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  44 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  49.56 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  51.33 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  44.98 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  43.42 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  47.16 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  48.46 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  45.37 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  45.81 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  40.91 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  48 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  46.72 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  43.37 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  49.27 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  47.37 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  47.19 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  44.3 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  46.9 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  39.82 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  45.85 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  48.12 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  49.12 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  44.17 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  47.8 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.05 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  45.22 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  45.13 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  39.76 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  47.81 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  47.14 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  47.71 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  45.49 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  44.69 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  46.49 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  45.41 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  44.49 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  48.25 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  45.73 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  46.7 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  43.48 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  44.3 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  43.86 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  46.02 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  46.26 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  43.23 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  43.17 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  42.42 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  45.05 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  42.11 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  46.7 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  41.56 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  45.28 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  45.13 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  41.56 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  43.64 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  43.64 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  43.64 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  43.64 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  43.64 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  43.64 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  43.64 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  43.64 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  43.64 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  41.99 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  43.61 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  45.69 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  43.81 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  43.46 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  41.15 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  45.3 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  43.46 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  43.46 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  41.88 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  46.72 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  43.17 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  43.46 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.29 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  43.46 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  46.02 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>