134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3385 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 843 aa  1754    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  54.91 
 
 		 368 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  53.17 
 
 		 358 aa  379  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  47.5 
 
 		 366 aa  335  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  45.56 
 
 		 377 aa  320  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  45.28 
 
 		 363 aa  319  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  45.2 
 
 		 358 aa  318  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  45.2 
 
 		 358 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  44.92 
 
 		 358 aa  313  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  42.97 
 
 		 955 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  43.34 
 
 		 358 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  44.83 
 
 		 358 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  46.11 
 
 		 357 aa  304  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  43.82 
 
 		 383 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  42.15 
 
 		 364 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  46.36 
 
 		 317 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  46.36 
 
 		 317 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  39.94 
 
 		 1082 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  41.92 
 
 		 695 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.95 
 
 		 734 aa  268  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.24 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  41.6 
 
 		 1077 aa  266  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  41.06 
 
 		 787 aa  265  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  40.41 
 
 		 686 aa  251  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  36.97 
 
 		 361 aa  250  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  38.5 
 
 		 381 aa  243  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  40.06 
 
 		 1247 aa  242  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 		 882 aa  241  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  41.5 
 
 		 751 aa  239  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  41.5 
 
 		 751 aa  239  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  35.31 
 
 		 372 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.65 
 
 		 957 aa  210  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4250  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 		 381 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3862  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 613 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1835  hypothetical protein  30.7 
 
 		 344 aa  159  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000690534  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  28.98 
 
 		 381 aa  102  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  28.72 
 
 		 381 aa  100  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4007  polysaccharide biosynthesis protein  63.04 
 
 		 47 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 377 aa  66.6  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 873 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  23.81 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  22.9 
 
 		 329 aa  57  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 450 aa  57.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.63 
 
 		 349 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 340 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 384 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 332 aa  55.5  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 359 aa  55.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  22.28 
 
 		 474 aa  55.1  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 384 aa  54.3  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 323 aa  54.7  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  21.05 
 
 		 339 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 323 aa  53.9  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.43 
 
 		 330 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.18 
 
 		 346 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 465 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 317 aa  52.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2394  radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 306 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0630696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  22.5 
 
 		 365 aa  51.6  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2252  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 404 aa  51.2  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  34.88 
 
 		 333 aa  51.2  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 1002 aa  51.2  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  25.13 
 
 		 413 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.25 
 
 		 298 aa  50.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 354 aa  50.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 458 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 332 aa  50.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 349 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 331 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 355 aa  50.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 1005 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  20.83 
 
 		 340 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 366 aa  49.3  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 382 aa  49.3  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 451 aa  48.9  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  25 
 
 		 354 aa  48.9  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 445 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 347 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 335 aa  48.9  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  31.03 
 
 		 397 aa  48.5  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  21.47 
 
 		 341 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 480 aa  48.1  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  29.25 
 
 		 311 aa  48.1  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  23.04 
 
 		 367 aa  47.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  32.93 
 
 		 337 aa  47.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  23.28 
 
 		 337 aa  47.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 389 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 337 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 331 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 433 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 358 aa  47  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.81 
 
 		 326 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 333 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>