More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2459 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  53.73 
 
 		 851 aa  783    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  47.28 
 
 		 866 aa  693    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  47.53 
 
 		 869 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  47.28 
 
 		 866 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  48.07 
 
 		 863 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  100 
 
 		 848 aa  1688    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  47.28 
 
 		 866 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 		 861 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  37.49 
 
 		 851 aa  485  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.6 
 
 		 838 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.43 
 
 		 777 aa  462  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  37.39 
 
 		 895 aa  445  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.19 
 
 		 849 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.8 
 
 		 933 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.43 
 
 		 856 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.59 
 
 		 910 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  40.27 
 
 		 1108 aa  365  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  39.26 
 
 		 702 aa  340  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.4 
 
 		 1004 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  30.63 
 
 		 796 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.77 
 
 		 863 aa  292  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.43 
 
 		 802 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.95 
 
 		 890 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.74 
 
 		 799 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.96 
 
 		 899 aa  273  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.88 
 
 		 799 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.61 
 
 		 878 aa  267  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.18 
 
 		 903 aa  261  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  30.8 
 
 		 770 aa  253  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  40.77 
 
 		 972 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  28.34 
 
 		 590 aa  162  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  31.43 
 
 		 282 aa  131  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  25.47 
 
 		 635 aa  127  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  39.23 
 
 		 249 aa  126  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  36.64 
 
 		 310 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 		 234 aa  124  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  35.43 
 
 		 741 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40.1 
 
 		 319 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  37.93 
 
 		 246 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  36.68 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  36.23 
 
 		 345 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  34.84 
 
 		 1470 aa  119  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  37.12 
 
 		 245 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  35.92 
 
 		 655 aa  119  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  33.02 
 
 		 309 aa  118  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  34.62 
 
 		 355 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 253 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.68 
 
 		 1462 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  35.23 
 
 		 323 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  34.26 
 
 		 308 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  37.5 
 
 		 1455 aa  117  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  32.87 
 
 		 304 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  35.42 
 
 		 672 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  32.89 
 
 		 244 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  37.14 
 
 		 515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  34.8 
 
 		 342 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  32.89 
 
 		 244 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 		 241 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  32.89 
 
 		 244 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  35.85 
 
 		 1536 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  31.4 
 
 		 333 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42103  ABC(ATP-binding) family transporter  33.82 
 
 		 1226 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166966  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  34.69 
 
 		 315 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.05 
 
 		 248 aa  115  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  32.35 
 
 		 306 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  32.44 
 
 		 244 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  35.82 
 
 		 1505 aa  115  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  28.12 
 
 		 541 aa  115  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  33.77 
 
 		 327 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  33.78 
 
 		 647 aa  115  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  33.89 
 
 		 1090 aa  115  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  30.34 
 
 		 244 aa  115  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.85 
 
 		 1448 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  36.79 
 
 		 1466 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  30.53 
 
 		 248 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  32.77 
 
 		 654 aa  114  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.17 
 
 		 244 aa  114  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  32.68 
 
 		 316 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  31.71 
 
 		 1476 aa  114  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.77 
 
 		 333 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  30.36 
 
 		 241 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  31.36 
 
 		 252 aa  114  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  36.68 
 
 		 265 aa  114  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  30.81 
 
 		 299 aa  114  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  30.81 
 
 		 299 aa  114  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  32.99 
 
 		 240 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  32.89 
 
 		 594 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  33.33 
 
 		 242 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.86 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.05 
 
 		 251 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  33.33 
 
 		 242 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  32.39 
 
 		 1445 aa  113  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 241 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  35.02 
 
 		 255 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  30.05 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  35.05 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.86 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  35.47 
 
 		 312 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  36.56 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>