More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2007 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 510 aa  972    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  65.48 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  55.11 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 		 516 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 508 aa  309  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 		 517 aa  306  8.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  44.81 
 
 		 517 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 525 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  40.85 
 
 		 525 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 525 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 528 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 517 aa  293  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  44.96 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 588 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 500 aa  286  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 500 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 495 aa  280  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 		 521 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  41.49 
 
 		 535 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.16 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 528 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 		 519 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 532 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 584 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  39.96 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 524 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 526 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 541 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  39.45 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 511 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.49 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  38.43 
 
 		 513 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 481 aa  263  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.94 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 513 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 575 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 		 507 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  38.43 
 
 		 514 aa  256  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 553 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 504 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  39.3 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 		 516 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 502 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 		 538 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 503 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 524 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 535 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.42 
 
 		 607 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 503 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  39.7 
 
 		 513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 		 519 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.61 
 
 		 525 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 539 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 563 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 519 aa  243  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.94 
 
 		 626 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 529 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 514 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 536 aa  239  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  38.15 
 
 		 501 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 536 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 514 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  34.35 
 
 		 492 aa  233  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  39.8 
 
 		 502 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.53 
 
 		 502 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 		 497 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.44 
 
 		 522 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.01 
 
 		 520 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.74 
 
 		 478 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.49 
 
 		 478 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 490 aa  225  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.49 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.76 
 
 		 486 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.76 
 
 		 486 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.76 
 
 		 486 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 486 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 486 aa  223  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 486 aa  223  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 506 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>