249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1656 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  59.35 
 
 		 218 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  56.19 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  56.19 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  53.3 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  53.08 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  53.08 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  53.08 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  57.94 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  53.55 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  49.78 
 
 		 225 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  56.4 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  46.7 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  46.7 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  50 
 
 		 273 aa  187  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  47.53 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  50.23 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  50.23 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  49.77 
 
 		 270 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  51.63 
 
 		 200 aa  174  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  48 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  43.53 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  44.13 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  45.45 
 
 		 243 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  44.76 
 
 		 262 aa  158  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  39.45 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  42.47 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  41.87 
 
 		 366 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  43.6 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  43.13 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  47.06 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  44.5 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  41.47 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  45.85 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  40.49 
 
 		 250 aa  138  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  44.95 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  47.14 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  40.1 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  39.81 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  45.07 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  38.03 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  39.52 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  35.75 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  41.59 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  42.71 
 
 		 235 aa  121  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  41.28 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  35.23 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  35.23 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  35.23 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  35.23 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  33 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  39.15 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  34.66 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  34.66 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  34.09 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  35.8 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  34.09 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  34.8 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  31.28 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  30.54 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  28.77 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  28.77 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  39.05 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  33.04 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  37.3 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  33.64 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  36.63 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  33.98 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  32.86 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  30.95 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  36.14 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  35.27 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  31.1 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  36.63 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  30.62 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  25.91 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  33.02 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  32.56 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  30.24 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  30.24 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  35.67 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  35.26 
 
 		 195 aa  99  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  30.95 
 
 		 205 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  32.65 
 
 		 208 aa  98.2  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  29.27 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  30.95 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  29.38 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  30.73 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  33.63 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  27.98 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  28.71 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  32.94 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  31.09 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  32.16 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  34.48 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  29.55 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03334  hemolysin III  32.13 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  33.14 
 
 		 268 aa  92  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  32.54 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>