249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3898 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  77.86 
 
 		 273 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  56.48 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  52.56 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  52.94 
 
 		 225 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  53.02 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  51.75 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  50.22 
 
 		 250 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  41.32 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  47.69 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  48.03 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  49.54 
 
 		 243 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  47.22 
 
 		 221 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  47.83 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  39.68 
 
 		 366 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  47.14 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  47.14 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  47.14 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  55.76 
 
 		 229 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  48.08 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  48.93 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  51.43 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  52.68 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  47.37 
 
 		 276 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  44.91 
 
 		 225 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  45.83 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  43.69 
 
 		 218 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  47.3 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  46.34 
 
 		 250 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  43.83 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  43.83 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  43.83 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  42.99 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  53.61 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  42.22 
 
 		 246 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  47.53 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  48.99 
 
 		 217 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  47.15 
 
 		 235 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  33.45 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  43.19 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  47.57 
 
 		 219 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  47.57 
 
 		 219 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  47.69 
 
 		 219 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  36.27 
 
 		 285 aa  138  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  45.23 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  37.07 
 
 		 218 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  40.24 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  35.5 
 
 		 232 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  39.64 
 
 		 208 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  37.28 
 
 		 217 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  32.57 
 
 		 214 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  32.34 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  32.34 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  32.34 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  28.85 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  32.75 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  32.75 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  28.85 
 
 		 215 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  32.34 
 
 		 215 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  28.85 
 
 		 215 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  31.43 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  28.37 
 
 		 215 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  31.14 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  36.84 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  36.84 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  37.72 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  36.9 
 
 		 215 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  36.96 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  35.87 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  35.87 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  35.87 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  35.87 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  35.87 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  35.87 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  35.87 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  35.87 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  35.87 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  31.14 
 
 		 215 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  37.35 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  33.16 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  33.16 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  33.16 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  33.16 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  33.16 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  35.29 
 
 		 215 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  35.37 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  34.34 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  35.67 
 
 		 192 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  32.31 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  36.42 
 
 		 239 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  36.78 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  32.93 
 
 		 216 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  36.69 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  34.12 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  32.53 
 
 		 216 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  36.69 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  35.47 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  34.91 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  35.47 
 
 		 227 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  36.31 
 
 		 227 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>