250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1453 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  99.07 
 
 		 215 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  52.34 
 
 		 215 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  51.87 
 
 		 215 aa  214  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  51.87 
 
 		 215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  51.87 
 
 		 215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  50.93 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  50.93 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  50.93 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  50.93 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  51.87 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  51.4 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  54.03 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  41.12 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  41.75 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  43.6 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  40.48 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  41.43 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  39.34 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  40.85 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  39.34 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  37.09 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  39.91 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  38.1 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  36.62 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  36.79 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  37.09 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  36.1 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  36.32 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  36.32 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  35.68 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  39.61 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  35.68 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  37.95 
 
 		 366 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  35.85 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  35.68 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  30.62 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  35.26 
 
 		 262 aa  121  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  33.82 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  33.91 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  34.8 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  38.57 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  36.32 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  32.39 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  37.9 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  38.14 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  31.86 
 
 		 242 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  30.66 
 
 		 270 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  36.15 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  36.1 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  32.75 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  35.96 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  34.43 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  32.18 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  30.7 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  34.43 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  34.43 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  34.43 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  34.43 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  34.43 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  32.68 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  31.48 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  30.37 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  33.49 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  34.43 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  36.47 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  34.93 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  34.93 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  34.93 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  34.93 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  34.93 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  34.93 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  34.93 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  34.93 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  34.93 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  35.09 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  37.14 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  34.13 
 
 		 250 aa  111  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  36.41 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  34.45 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  34.56 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  34.91 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  36.49 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  34.91 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  36.02 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  32.74 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  35.92 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  35.41 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  35.41 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  34.6 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  34.43 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  33.97 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  32.7 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  33.17 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  33.96 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  33.96 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  33.96 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  33.96 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  33.96 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>