253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1904 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  100 
 
 		 232 aa  454  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  57.14 
 
 		 216 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  55.71 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  54.03 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  53.55 
 
 		 215 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  49.29 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  48.33 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  47.2 
 
 		 214 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  48.08 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  44.29 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  44.29 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  44.29 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  44.29 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  44.76 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  44.29 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  44.29 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  44.29 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  44.29 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  42.38 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  44.44 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  41.82 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  45.15 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  42.73 
 
 		 214 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  43.96 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  44.13 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  41.74 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  42.92 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  41.06 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  41.06 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  39.44 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  38.16 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  41.35 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  42.45 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  41.84 
 
 		 366 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  41.15 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  41.35 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  40.58 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  41.15 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  40.87 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  41.55 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  42.11 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  41.15 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  41.15 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  42.03 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  42.03 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  42.03 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  41.89 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  41.55 
 
 		 205 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  40 
 
 		 204 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  37.61 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  42.31 
 
 		 205 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  40.99 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  41.44 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  41.44 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  40.58 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  40.99 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  41.06 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  40.58 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  41.06 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  39.71 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  40.58 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  41.7 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  41.06 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  41.06 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  41.06 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  41.06 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  40.99 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  40.99 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  40.99 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  40.99 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  40.99 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  40.65 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  36.52 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  39.05 
 
 		 204 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  40.38 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  40.54 
 
 		 218 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  40.28 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  40.1 
 
 		 206 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  40.62 
 
 		 218 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  41.06 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  38.84 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  41.06 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  40.58 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  39.23 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  39.82 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  41.33 
 
 		 217 aa  135  7.000000000000001e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  38.57 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  39.23 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  37.5 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  39.42 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  38.94 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  38.16 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  38.29 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  38.29 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  38.29 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  40.48 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  38.29 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  38.29 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  38.29 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  38.29 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>