252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2247 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 215 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  74.88 
 
 		 215 aa  314  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  72.04 
 
 		 214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  58.65 
 
 		 217 aa  254  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  54.46 
 
 		 216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  48.83 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  49.29 
 
 		 232 aa  202  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  42.79 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  42.79 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  42.79 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  42.33 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  42.33 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  42.33 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  42.65 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  42.33 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  42.33 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  44.17 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  44.17 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  44.66 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  43.13 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  44.17 
 
 		 205 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  41.59 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  41.12 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  45.5 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  44.17 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  46.89 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  44.17 
 
 		 205 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  44.44 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  44.93 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  44.93 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  44.93 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  44.44 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  44.44 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  44.44 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  44.44 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  44.44 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  44.44 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  44.44 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  41.26 
 
 		 205 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  43 
 
 		 205 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  42.58 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  44.93 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  43.96 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  43.96 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  43.96 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  44.23 
 
 		 206 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  40.58 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  42.72 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  43.63 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  45.28 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  43.48 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  41.71 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  43 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  40.78 
 
 		 204 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  43.27 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  42.23 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  43.35 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  40.29 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  39.81 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  43.69 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  42.65 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  40.49 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  39.81 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  39.34 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  41 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  42.51 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  37.2 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  42.65 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  44.61 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  38.28 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  43.69 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  35.58 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  36.1 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  39.52 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  39.02 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  37.56 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  36.11 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  41.87 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  37.56 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  41.58 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  39.25 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  38.68 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  39.25 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  39.25 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  39.25 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  39.25 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  39.25 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  38.79 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  37.31 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  39.18 
 
 		 270 aa  131  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  43.87 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  38.57 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  38.79 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  39.44 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  38.79 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  36.23 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  38.79 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  38.21 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  36.94 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>