249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0096 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  93.33 
 
 		 225 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  60.38 
 
 		 270 aa  261  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  57.08 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  56.6 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  56.34 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  56.34 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  56.34 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  52.56 
 
 		 305 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  50.89 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  52.42 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  54.72 
 
 		 242 aa  222  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  51.79 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  54.07 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  53.95 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  47.75 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  46.41 
 
 		 268 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  49.52 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  46.67 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  49.77 
 
 		 249 aa  185  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  48.17 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  46.7 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  49.05 
 
 		 262 aa  180  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  46.83 
 
 		 366 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  47.3 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  47.3 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  46.23 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  45.98 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  45.28 
 
 		 276 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  43.66 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  41.28 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  47.34 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  42.67 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  49.4 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  42.86 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  42.38 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  44.98 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  44.98 
 
 		 219 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  47.68 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  45.93 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  45.32 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  40.27 
 
 		 239 aa  138  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  38.84 
 
 		 314 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  37.56 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  39.02 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  47.56 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  31.02 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  39.13 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  35.03 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  30.62 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  35.47 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  30.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  30.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  35.07 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  32.09 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  30.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  33.16 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  32.09 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  37.76 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  31.55 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  32.09 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  30.98 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  39.55 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  38.03 
 
 		 285 aa  118  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  39.55 
 
 		 195 aa  118  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  38.98 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  38.82 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  30.43 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  42.01 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  36.59 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  36.27 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  34.96 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  34.72 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  33.79 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  33.49 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  36.31 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  33.52 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  31.66 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  30.05 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  31.6 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  34.2 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  31.28 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  37.06 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  27.65 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  34.38 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  28.34 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  32.77 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0661  Hly-III related proteins  34.91 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  33.17 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  32.28 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  27.67 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  33.17 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  34.9 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  34.9 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  34.9 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1319  hemolysin III, putative  33.15 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  34.9 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  34.38 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  34.9 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  32.14 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>