249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0832 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  77.86 
 
 		 305 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  55.35 
 
 		 270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  50.89 
 
 		 225 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  48.76 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  53.18 
 
 		 225 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  50.45 
 
 		 225 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  50.9 
 
 		 243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  52.15 
 
 		 242 aa  219  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  47.6 
 
 		 274 aa  218  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  47.11 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  49.77 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  54.82 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  43.07 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  49.05 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  49.05 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  49.05 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  38.76 
 
 		 366 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  46.15 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  43.57 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  51.67 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  52.38 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  43.57 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  50.89 
 
 		 246 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  47.91 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  46.86 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  43.2 
 
 		 225 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  48.34 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  44.89 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  43.48 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  42.61 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  53.89 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  44.09 
 
 		 270 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  43.84 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  43.84 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  51.01 
 
 		 217 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  46.3 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  38.57 
 
 		 314 aa  152  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  44.56 
 
 		 235 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  47.09 
 
 		 219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  47.09 
 
 		 219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  42.06 
 
 		 239 aa  145  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  47.44 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  36.41 
 
 		 285 aa  142  8e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  45.73 
 
 		 216 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  38.6 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  39.05 
 
 		 213 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  37.5 
 
 		 215 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  34.32 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  33.53 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  33.53 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  33.53 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  29.38 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  33.53 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  34.76 
 
 		 218 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  35.67 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  32.93 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  29.38 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  35.67 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  37.5 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  28.91 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  32.18 
 
 		 215 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  32.18 
 
 		 215 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 		 208 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  39.13 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  35.12 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  30.68 
 
 		 214 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  30.99 
 
 		 223 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  31.74 
 
 		 215 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  29.47 
 
 		 215 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  34.5 
 
 		 192 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  32.93 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  31.55 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1319  hemolysin III, putative  33.7 
 
 		 214 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  30 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  35.67 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  32.65 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  30.19 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  35.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  35.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  35.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  35.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  35.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  35.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  33.53 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  35.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  35.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  35.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  34.34 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  34.34 
 
 		 215 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  35.63 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  34.34 
 
 		 219 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  36.9 
 
 		 231 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  34.34 
 
 		 219 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  34.34 
 
 		 219 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  34.34 
 
 		 219 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  32.93 
 
 		 215 aa  99  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  34.34 
 
 		 219 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  34.32 
 
 		 216 aa  99  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  34.34 
 
 		 218 aa  98.6  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>