250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2335 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  69.38 
 
 
224 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  58.92 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  60.3 
 
 
366 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  54.67 
 
 
249 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  55.35 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  56.86 
 
 
221 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  53.37 
 
 
274 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  55.61 
 
 
218 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  50 
 
 
262 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  52.32 
 
 
250 aa  224  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  53.81 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  53.02 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  52.4 
 
 
276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  49.77 
 
 
273 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  49.54 
 
 
305 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  43.83 
 
 
246 aa  201  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  43.16 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  48.1 
 
 
270 aa  191  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  45.71 
 
 
225 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  41.85 
 
 
314 aa  177  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  41.56 
 
 
247 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  41.56 
 
 
247 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  41.56 
 
 
247 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  43.66 
 
 
225 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  44.29 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  42.06 
 
 
229 aa  168  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  43.81 
 
 
243 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  43.38 
 
 
242 aa  168  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  42.27 
 
 
225 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  42.92 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  44.55 
 
 
218 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  44.3 
 
 
270 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  43.86 
 
 
270 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  43.86 
 
 
270 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  49.74 
 
 
217 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  36.6 
 
 
285 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  46.15 
 
 
200 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  41.86 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  48.8 
 
 
224 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  46.11 
 
 
235 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  50 
 
 
213 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  44.5 
 
 
219 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  42.58 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  42.58 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  40.12 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  44.39 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  42.77 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  40.12 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  38.6 
 
 
192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  38.86 
 
 
217 aa  121  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  32.21 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  32.21 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  32.21 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  31.25 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  30.77 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  30.77 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  32.21 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  29.61 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  30.77 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  31.6 
 
 
215 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  39.69 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  38.85 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  29.76 
 
 
215 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  29.76 
 
 
215 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  31.76 
 
 
214 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  38.55 
 
 
216 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  36.31 
 
 
215 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  29.17 
 
 
223 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  36.31 
 
 
216 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  35.96 
 
 
215 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  33.49 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  30.06 
 
 
209 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  30.73 
 
 
215 aa  93.6  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  31.52 
 
 
218 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  38.12 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  29.09 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  34.69 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  34.09 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  35.93 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  33.55 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  32.93 
 
 
215 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  30.12 
 
 
208 aa  86.3  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  34.25 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1319  hemolysin III, putative  28.82 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  34.23 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  32.91 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  32.91 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  29.65 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  32.91 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  30.57 
 
 
216 aa  82  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  30.43 
 
 
205 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  30.05 
 
 
220 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  35.92 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  29.84 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  32.28 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  33 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  32.28 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>