252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0862 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0862  HylII  100 
 
 		 366 aa  735    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  60.84 
 
 		 268 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  59.62 
 
 		 243 aa  262  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  60.38 
 
 		 224 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  50.61 
 
 		 254 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  54.63 
 
 		 221 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  49.79 
 
 		 249 aa  229  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  48.16 
 
 		 274 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  55.71 
 
 		 218 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  51.1 
 
 		 225 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  44.19 
 
 		 262 aa  219  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  48.15 
 
 		 250 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  54.81 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  38.71 
 
 		 273 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  38.63 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  47.64 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  45.73 
 
 		 246 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  44.02 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  46.54 
 
 		 243 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  46.6 
 
 		 225 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  45.15 
 
 		 270 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  46.41 
 
 		 225 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  46.89 
 
 		 239 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  40.85 
 
 		 243 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  44.76 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  37.25 
 
 		 242 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  39.26 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  39.26 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  39.26 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  42.03 
 
 		 218 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  43.41 
 
 		 229 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  44.67 
 
 		 217 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  48.11 
 
 		 216 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  50 
 
 		 217 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  47.34 
 
 		 219 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  45.21 
 
 		 218 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  40.48 
 
 		 232 aa  145  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  44.62 
 
 		 235 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  37.38 
 
 		 225 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  41.62 
 
 		 213 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  41.63 
 
 		 225 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  44.66 
 
 		 219 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  45.54 
 
 		 219 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  36.72 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  42.64 
 
 		 208 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 270 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 270 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  43.37 
 
 		 224 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  40.46 
 
 		 215 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  37.89 
 
 		 216 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  34.95 
 
 		 215 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  37.87 
 
 		 215 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  34.95 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  34.95 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  34.95 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  37.87 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  34.95 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  41.92 
 
 		 192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  33.5 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  33.5 
 
 		 215 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  33.5 
 
 		 215 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  33.5 
 
 		 215 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  40.72 
 
 		 195 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  40.72 
 
 		 195 aa  126  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  33.98 
 
 		 215 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  39.44 
 
 		 200 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 		 214 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  38.73 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  38.46 
 
 		 214 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  43.68 
 
 		 241 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  35.06 
 
 		 223 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  37.02 
 
 		 216 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  38.98 
 
 		 226 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  33.02 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  33.19 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  33.47 
 
 		 227 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  36.63 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  36.05 
 
 		 218 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  38.01 
 
 		 268 aa  106  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  37.21 
 
 		 227 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  32.52 
 
 		 236 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  38.37 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  37.21 
 
 		 227 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  37.21 
 
 		 227 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  34.59 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  31.75 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  42.86 
 
 		 205 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  34.83 
 
 		 227 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  37 
 
 		 215 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  34.76 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  38.86 
 
 		 214 aa  102  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  35.18 
 
 		 216 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  35.18 
 
 		 216 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  34.68 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  31.53 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  31.63 
 
 		 215 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  35.54 
 
 		 215 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  34.13 
 
 		 205 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  39.7 
 
 		 214 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>