250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0623 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  100 
 
 
216 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  57.82 
 
 
215 aa  260  8.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  58.85 
 
 
209 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  45.41 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  50.25 
 
 
218 aa  210  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  50.24 
 
 
218 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  50.24 
 
 
218 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  50.24 
 
 
218 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  49.76 
 
 
239 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  49.76 
 
 
218 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  49.76 
 
 
218 aa  208  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  49.76 
 
 
218 aa  208  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  49.76 
 
 
218 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  49.76 
 
 
218 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  50.75 
 
 
218 aa  208  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  49.02 
 
 
211 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  47 
 
 
220 aa  205  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  49.5 
 
 
216 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  46.63 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  50.96 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  46.6 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  42.92 
 
 
214 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  47 
 
 
214 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  48.02 
 
 
213 aa  194  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  45.89 
 
 
220 aa  193  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  45.58 
 
 
217 aa  189  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  46.6 
 
 
518 aa  187  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  47.17 
 
 
227 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  43.46 
 
 
215 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  46.46 
 
 
219 aa  185  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  42.65 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  45.19 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0909  hemolysin III-like protein  42.23 
 
 
221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301026 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  44.29 
 
 
218 aa  181  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  44.67 
 
 
214 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  42.38 
 
 
230 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  44.16 
 
 
214 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  43 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  45.81 
 
 
224 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  44.33 
 
 
257 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  42.4 
 
 
218 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  43 
 
 
215 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0520  hemolysin like protein  42.99 
 
 
217 aa  176  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  44.88 
 
 
219 aa  176  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  42.92 
 
 
216 aa  175  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  39.23 
 
 
259 aa  175  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  42.93 
 
 
206 aa  174  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.837096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  43.06 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  43.06 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  43.06 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  43.06 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  43.06 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  41.67 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  43.06 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  43.06 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  43.06 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  43.06 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  46.38 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  40 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  39.91 
 
 
215 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  42.44 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  39.91 
 
 
215 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  43.41 
 
 
206 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  40 
 
 
227 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 
227 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  42.93 
 
 
206 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  42.93 
 
 
206 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  43.41 
 
 
206 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  43.41 
 
 
206 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  43.2 
 
 
206 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  42.93 
 
 
206 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  42.93 
 
 
206 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  42.93 
 
 
206 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  42.93 
 
 
206 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  41.23 
 
 
219 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  41.23 
 
 
219 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  41.23 
 
 
219 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  41.23 
 
 
219 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  40.78 
 
 
227 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  41.75 
 
 
219 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  41.95 
 
 
206 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  41.35 
 
 
215 aa  168  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  44.12 
 
 
206 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  41.38 
 
 
227 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0771  hemolysin III family channel protein  45.63 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  41.95 
 
 
206 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  41.95 
 
 
206 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  41.95 
 
 
206 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  42.72 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  43.22 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  41.55 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  41.55 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  42.36 
 
 
233 aa  161  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  44.12 
 
 
205 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  38.83 
 
 
226 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  38.54 
 
 
214 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1934  hemolysin III family channel protein  42.72 
 
 
227 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.680237  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  42.86 
 
 
205 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1879  hemolysin III family channel protein  43.69 
 
 
227 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2099  hemolysin III family channel protein  43.69 
 
 
227 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  0.972179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>