249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3032 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  99.54 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  99.54 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  99.54 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  99.54 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  99.54 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  99.54 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  99.54 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  99.54 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  91.78 
 
 		 219 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  91.78 
 
 		 219 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  91.78 
 
 		 219 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  91.78 
 
 		 219 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  91.32 
 
 		 219 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  87.56 
 
 		 218 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  81.48 
 
 		 216 aa  363  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  84.95 
 
 		 215 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  83.65 
 
 		 215 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  77.67 
 
 		 215 aa  349  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  78.97 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  73.83 
 
 		 233 aa  311  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  73.83 
 
 		 233 aa  311  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  76.21 
 
 		 233 aa  310  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  69.86 
 
 		 233 aa  301  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  66.98 
 
 		 217 aa  298  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  73.33 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  61.65 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  54.21 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  50.23 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  52.34 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  53.74 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  50.93 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  52.83 
 
 		 227 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2447  hemolysin III family channel protein  55.14 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1879  hemolysin III family channel protein  54.67 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  52.91 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2099  hemolysin III family channel protein  54.21 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1934  hemolysin III family channel protein  52.8 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.680237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  53.4 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  50.97 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  49.76 
 
 		 226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  48.77 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  53.99 
 
 		 249 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  49.76 
 
 		 214 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  51.46 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  46.86 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  50 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  45.89 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  49.52 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  49.25 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  45.19 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  49.06 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  44.91 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  46.41 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  51.98 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  42.59 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  43.52 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  43.52 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  43.52 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  43.52 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  43.84 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  43.52 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  43.52 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  43.52 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  43.52 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  47.44 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  43.14 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  43.06 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  41.86 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1768  hemolysin III family channel protein  46.26 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000462203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  44.44 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  44.44 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  43.06 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  43.78 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  48.02 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  45.45 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  43.66 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  43.56 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  44.06 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0605  Hly-III family protein  39.81 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0995  Hly-III family protein  40.58 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  43.2 
 
 		 518 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  43.07 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  40.28 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  43.07 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  43.07 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  43.07 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  44.06 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  44.06 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  44.06 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  44.06 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  44.06 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  44.06 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0867  Hly-III family protein  38.97 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296032  normal  0.935947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  43.56 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>