249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2099 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2099  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1879  hemolysin III family channel protein  98.24 
 
 		 227 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1934  hemolysin III family channel protein  96.48 
 
 		 227 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.680237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  81.06 
 
 		 227 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  82.46 
 
 		 227 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  81.06 
 
 		 227 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  80.62 
 
 		 227 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2447  hemolysin III family channel protein  93.09 
 
 		 217 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  82.02 
 
 		 227 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  69.6 
 
 		 226 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  68.72 
 
 		 226 aa  308  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  66.24 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  68.47 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  67.31 
 
 		 227 aa  278  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  55.84 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1768  hemolysin III family channel protein  58.9 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000462203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  54.46 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  54.21 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  54.21 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  54.21 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  54.21 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  54.21 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  56.07 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  54.21 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  54.21 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  54.21 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  54.21 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  55.56 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  55.56 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  55.56 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  55.56 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  55.56 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  55.14 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  53.17 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  51.66 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  52.8 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  51.87 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  50.7 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  52.09 
 
 		 215 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  50.49 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  48.15 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  47.34 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  54.81 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  47.14 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  48.86 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  47.06 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  48.89 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  47.06 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  48.89 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  48.89 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  45.33 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  45.33 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  45.33 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  45.33 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  45.33 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  45.33 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  45.33 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  45.33 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  45.33 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  46.83 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  49.75 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  44.04 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  46.34 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  44.65 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  43.69 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  45.59 
 
 		 216 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  42.93 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  47.55 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  39.91 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  43.95 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  45.69 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  42.93 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  42.93 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  38.83 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  45.37 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  40.45 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  39.91 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  39.62 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  41.29 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  36.17 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  42.79 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  36.45 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0909  hemolysin III-like protein  38.57 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301026 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0520  hemolysin like protein  38.89 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  37.74 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  40.8 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  40.8 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  40.8 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  41.29 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  42.29 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  41.29 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1381  hemolysin III-like protein  36.57 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.438791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  42.29 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0661  Hly-III related proteins  40.59 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  39.3 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  40.5 
 
 		 208 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  40.97 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  40.1 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>