249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5431 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  93.69 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  93.69 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  93.69 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  93.2 
 
 		 206 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  91.26 
 
 		 206 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  91.75 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  91.75 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  92.23 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  91.75 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  91.75 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  91.75 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  91.75 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  89.81 
 
 		 206 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  89.81 
 
 		 206 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  88.83 
 
 		 206 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  64.08 
 
 		 206 aa  285  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  66.5 
 
 		 205 aa  272  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  64.39 
 
 		 205 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  64.88 
 
 		 205 aa  256  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  63.59 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  60.49 
 
 		 205 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  61.65 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  60.49 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  60 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  59.51 
 
 		 205 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  63.11 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  57.56 
 
 		 205 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  56.59 
 
 		 205 aa  234  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  56.1 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  56.59 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  56.59 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  55.61 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  55.61 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  52.74 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  47.34 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  46.86 
 
 		 208 aa  198  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  55.12 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  47.72 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  48.26 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  45.96 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  47.26 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  44.88 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  46.77 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  46.27 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  44.67 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  45.27 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  45.73 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  47.26 
 
 		 518 aa  175  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  47.72 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  46.27 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  46.27 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  47.72 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  45.77 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  45.77 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  45.77 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  45.77 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  45.77 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  46.27 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  45.77 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  44.78 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  45.27 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  43.41 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  42.5 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  44 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  49.03 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  45.81 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  43.65 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  45.05 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  41.38 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  46.31 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  43.35 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  44.93 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  41.18 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  45.05 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  45.54 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  45.54 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  45.54 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  45.54 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  45.05 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  45.54 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2360  channel protein, hemolysin III family  42.86 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1993  channel protein, hemolysin III family  42.86 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0837698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  41.87 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3552  hemolysin III family channel protein  45.77 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  42.5 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  48.74 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  45.5 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  42.36 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  44.33 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  43.35 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>