250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1696 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  100 
 
 
214 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  72.04 
 
 
215 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  69.67 
 
 
215 aa  288  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  54.33 
 
 
217 aa  234  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  50.95 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  50 
 
 
216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  47.2 
 
 
232 aa  205  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  41.06 
 
 
223 aa  165  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  41.98 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  41.04 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  41.04 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  41.98 
 
 
215 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  41.98 
 
 
215 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  41.04 
 
 
215 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  41.98 
 
 
215 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  40.57 
 
 
215 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  41.98 
 
 
215 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  40.85 
 
 
215 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  40.48 
 
 
215 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  41.51 
 
 
215 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  45.1 
 
 
213 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  38.1 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  39.62 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  42.03 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  40.39 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  42.93 
 
 
218 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  41 
 
 
205 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  39.42 
 
 
224 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  38.68 
 
 
206 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  38.68 
 
 
206 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  41 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  37.32 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  41 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  36.84 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  38.39 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  39.61 
 
 
220 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  36.41 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  38.39 
 
 
206 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  41.71 
 
 
208 aa  138  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  39.32 
 
 
218 aa  138  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  40.5 
 
 
205 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  41.26 
 
 
214 aa  138  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  40 
 
 
205 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  42 
 
 
366 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  36.54 
 
 
219 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  36.54 
 
 
219 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  36.54 
 
 
219 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  36.54 
 
 
215 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  36.41 
 
 
204 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  36.54 
 
 
219 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  37.5 
 
 
216 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  36.54 
 
 
219 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  36.54 
 
 
219 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  36.54 
 
 
219 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  38.83 
 
 
205 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  36.54 
 
 
219 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  40.89 
 
 
214 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  40.95 
 
 
221 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  36.54 
 
 
219 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  37.86 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  37.5 
 
 
219 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  37.5 
 
 
219 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  37.26 
 
 
206 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  37.5 
 
 
219 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  41.83 
 
 
233 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  37.5 
 
 
219 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  37.5 
 
 
219 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  37.26 
 
 
206 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  41.83 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  41.83 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  38.83 
 
 
205 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  36.79 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  36.79 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  36.79 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  36.79 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  36.79 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  36.79 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  36.79 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  36.79 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  36.79 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  36.79 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  36.54 
 
 
215 aa  131  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  36.41 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  44.62 
 
 
195 aa  131  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  34.47 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  40.59 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  36.32 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  36.59 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  37.07 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  35.58 
 
 
215 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  35.78 
 
 
230 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  36.06 
 
 
215 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  44.09 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  40.2 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  34.31 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  36.23 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  43.75 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  40.2 
 
 
214 aa  128  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  35.58 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  36.96 
 
 
305 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>