247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4414 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  60.93 
 
 		 225 aa  261  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  53.81 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  53.81 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  53.81 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  54.76 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  53.81 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  53.95 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  54.42 
 
 		 225 aa  224  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  60.48 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  53.27 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  53.81 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  54.63 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  48.34 
 
 		 273 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  47.3 
 
 		 305 aa  201  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  56.13 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  54.29 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  53.81 
 
 		 270 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  53.81 
 
 		 270 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  53.71 
 
 		 200 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  42.01 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  46.34 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  42.38 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  45.37 
 
 		 276 aa  162  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  41.86 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  45.75 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  42.59 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  45.89 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  40.48 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  44.34 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  43.81 
 
 		 274 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  41.87 
 
 		 366 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  39.3 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  44.71 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  43.9 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  39.81 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  47.37 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  41.23 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  36.04 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  48.5 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  45.54 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  46.53 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  45.54 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  36.49 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  36.32 
 
 		 215 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  37.39 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  39.77 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  39.77 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  39.77 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  32.85 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  32.85 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  32.85 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  32.85 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  43.28 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  42.21 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  35.15 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  36.31 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  29.47 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  29.95 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  29.95 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  31.46 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  32.68 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  29.95 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  29.52 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  38.69 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  29.52 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  30.95 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  32.74 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  33.94 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  32.14 
 
 		 214 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  41.18 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  35.12 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  34.52 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  36.53 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  36.53 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  36.31 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  32.84 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  36.97 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  37.13 
 
 		 249 aa  92.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  34.85 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  34.62 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  35.71 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  32.18 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0995  Hly-III family protein  33.66 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  35.98 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  32.64 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0867  Hly-III family protein  33.17 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296032  normal  0.935947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  35.09 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  31.38 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  33.33 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  34.03 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  34.03 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  33.73 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  34.03 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  34.03 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  33.96 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1271  Hemolysin III  35.26 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  34.03 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  29.28 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  31.95 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>